食品微生物室的功能室主要包括：办公室、通用实验室、灭菌室、准备室、更衣室、缓冲室、无菌室、培养室等。下面起码主要来看看以下三个功能室：

　　1、办公室

　　实验室的办公室是检验工作人员办公的地方，其面积应20平方米左右，通风采光好，内设基本的办公桌、椅、电脑、存放资料和留样的柜等。检验工作人员可以在办公室里登记待检验的样品、出检验报告和处理有关的文件资料等，也可供工作人员在工作过程中放松休息，以便更清醒地思考问、分析和解决问题，极大地提高工作效率。

　　2、通用实验室

　　通用实验室是进行微生物学检验准备工作和非无菌操作实验时使用，也可供理化检验及科研工作使用。通用实验室应设有较大的长方形工作台作为实验操作台，台下设计了各专用仪器柜，台面用石板加塑胶垫等不易腐蚀和稳固耐用的材料设置，并设有专用搁物架。另外，还应设置一个适当大小的通风橱，内配有排气系统和安装给排水系统，如水槽及水槽上的各种水龙头。实验室的地面设计为水磨石地面，这样既容易清洁和不易积水方便工作。有良好的通风照明设备和消防设施。

　　通用实验室为了方便实验工作的开展，通常配备了常用的仪器(分光光度计、PH计、烘箱、电炉等)及常用的各种玻璃器皿和常用的各种化学试剂、药品。此外，还应配有清洁用工具和工作服。如果工厂条件许可，检验人员可以根据分工各自拥有专用的实验工作台或工作地方以达到快速、高效完成检验任务。

　　3、灭菌室

　　灭菌室是培养基及有关的检验材料灭菌之场所。灭菌设备是高压设备，具有一定的危险性，所以灭菌室应与办公室保持一定距离以保证安全，使用时应有专人操作，但也要方便工作，通常设在通用实验室附近并与之保持一定距离(如隔一条走廊的距离或小房间的距离)，以减少影响。灭菌室内安装有灭菌锅等灭菌设备。如果有条件的工厂可以配置更好的仪器设备(如双扇高压灭菌柜和安全门等设施)。另外，灭菌室里应水电齐备并有防火措施和设备，人员要遵守安全操作制度。